効果が高く安全性の高いsiRNA設計ツールsiDirectパッケージ版 siDirectPlus

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siDirectPlus 2024年版をリリースいたしました！

  • オフターゲット候補遺伝子としてシード領域に相補的な配列を3'-UTR領域にもつ遺伝子を抽出できる機能が追加されました！
  • 同梱されるデータベースを参照して遺伝子配列を入力できるようになったため、完全にオフラインで使用することができるようになりました！
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特徴

 

1　設計したsiRNAの98％が効果を示す
siDirectPlusは、程准教授らが提唱した特許取得のルール（特許第3839453号）を用いています。
なので、効果の高いsiRNAを設計できます。

 

２　安全性を正確に予測できる
オフターゲット効果の予測にGGGenomeパッケージ版を使用しているので、正確で漏れのない検索が可能です。また、計算されるパラメータからオフターゲット効果の低い条件のsiRNAを選定できます。
製品活用支援で安心活用
siRNAを設計する際の留意点など、製品を活用していただく際のノウハウを支援させていただきます。
設計受託業務サービス
RNA分子設計受託業務も準備しております。企業内での設計が困難な場合にご支援させていただきます。
小見出し
ここをクリックして表示したいテキストを入力してください。テキストは「右寄せ」「中央寄せ」「左寄せ」といった整列方向、「太字」「斜体」「下線」「取り消し線」、「文字サイズ」「文字色」「文字の背景色」など細かく編集することができます。
ボタン
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ウェブ版とパッケージ版の違い

siDirectPlusでは類似塩基配列の検索をGGGenomeで確認できます

類似塩基配列をGGGenomeパッケージ版で確認できるので、検索対象データベースを
創薬基本パックから選んだりミスマッチの数を変えて検索することが可能です。
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オフターゲット候補遺伝子のヒットポジションを確認できます

オフターゲット候補遺伝子のどこにヒットするか、ポジションを確認できます。
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その他、詳細はよくある質問をごらんください。
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提供形態

その１
本製品はUSBメモリもしくはSSDメモリでのご提供となります
その２
本製品はGGGenomeパッケージ版（最新版）とセットでのご提供となります
メリット
ここをクリックして表示したいテキストを入力してください。
ここをクリックして表示したいテキストを入力してください。テキストは「右寄せ」「中央寄せ」「左寄せ」といった整列方向、「太字」「斜体」「下線」「取り消し線」、「文字サイズ」「文字色」「文字の背景色」など細かく編集することができます。テキストテキストテキストテキストテキストテキストテキストテキストテキスト...。テキストテキストテキストテキストテキストテキストテキストテキストテキスト...。テキストテキストテキストテキストテキストテキストテキストテキストテキスト...。

動作環境

  • 本製品は64bit版Windowsに対応しています。
  • Windows 11 Pro version 21H2 以上、もしくはEnterprise / Education version 21H2 以上
  • Windows 10 Pro 21H1　以上、もしくは Enterprise / Education 20H2 以上
  • Hyper-Vの有効化 (VMWareなどの仮想化ソフトと排他になる可能性があります)
  • メモリ: 8GB以上 (Docker for Windowsに最低4GB以上割り当てる必要があります)
  • ここをクリックして表示したいテキストを入力してください。
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よくある質問

Q. ウェブ版とパッケージ版の違いを詳しく教えて下さい

ウェブ版とパッケージ版の違いについては、下記のとおりです。
・Accession Noからの配列入力の際に、①外部データベースへの問合せ、②同梱データベースからの配列取得の２つから選択することができます。①外部データベースへの問合せの際には、外部接続警告が表示されます。
・設計したsiRNAリストについて、テキストのコピーだけでなく、csvファイルへの出力にも対応しています。
・類似配列検索エンジンのローカル化。GGGenomeパッケージ版を用いて類似配列を検索します。
・特異性確認の検索対象は、同梱データベースより、ヒト、マウス、ラットのRefseq最新版のみに対応しています。
・オフターゲット候補遺伝子検索条件は、GGGenomeパッケージ版の機能を用いて任意に設定できるほか、Bioret toolの機能を用いて一括で変更することができます。
・オフターゲット候補遺伝子検索対象は、GGGenomeパッケージ版の機能を用いて任意に設定できるほか、Bioret toolの機能を用いて一括で変更することができます。
・オフターゲット候補遺伝子の情報として、ヒットポジションが出力されます。
・オフターゲット候補遺伝子リストは、Bioret toolの機能を用いて一括で出力することができます。
・オフターゲット候補遺伝子として、シード領域（ガイド鎖の2-8位の７塩基）に相補的な配列を3'-UTR領域にもつ遺伝子を抽出、出力することができます。

Q. ライセンスの形態を教えて下さい

siDirectPlusはサブスクリプションプランでのライセンス許諾となり、原則1年ごとに更新させていただきます。

Q. 設計したsiRNAの利用制限はありますか

siDirectPlusを用いて設計したsiRNAについては、研究目的・商用目的を問わずご使用いただけます。論文発表等の際には「siDirectPlusを使用して設計した」旨をご記載ください。
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